核电站在辐射避难所中虽然能提供高效电力支持，但也会带来辐射污染、资源消耗、布局限制和突发事件等多重副作用。作为后期解锁的高级建筑，其高额建造升级成本（三联一级需1200瓶盖，二级1500，三级1800，总投入达25500瓶盖）对前期运营构成压力，且需搭配防护措施才能保障居民安全。
核电站的辐射特性会直接影响工作居民的健康状态，长期暴露可能导致血量下降或需要持续消耗消辐宁。尽管游戏未明确模拟现实中的白血病或不孕等极端影响，但辐射伤害会通过降低居民工作效率和增加医疗资源消耗间接影响避难所运营。若电力供应不足时强行拆除旧发电站，可能导致生产链崩溃，需确保核电站完全覆盖需求后再逐步替换原有设施。
核电站的占地面积和位置选择会显著影响避难所整体布局。传统攻略建议将其放置在一楼大门附近以应对入侵，但实验显示量子可乐厂的伤害分摊机制更适合防御。若将核电站置于中层，又可能因电力传输效率问题导致边缘房间供电不稳定。核电站必须与同层其他房间保持间隔，无法像普通发电站那样灵活组合成三联房间，这进一步限制了空间利用率。
突发事件方面，核电站遭遇火灾或虫害时，辐射泄漏会加剧灾害影响。幸存者模式下需特别注意死爪入侵与电力短缺的连锁反应，建议在核电站层常驻高属性武装居民。后期可搭配巧手先生机器人自动收集资源，但需避免其在该区域被摧毁，否则5000瓶盖的复活成本将加重经济负担。核电站的辐射不会影响相邻楼层居民，这为垂直布局提供了优化空间。
从游戏机制看，核电站的副作用主要来源于设计平衡性而非真实物理模拟。其59电力的满级产能虽是普通发电站的1.5倍，但综合考虑建造周期、风险成本和替代方案（如核子可乐厂），玩家需根据人口规模和发展阶段审慎选择。对于追求极限效率的存档，建议在100人口后通过SL大法快速完成升级；休闲玩家则更适合保留部分发电站维持稳定。
